Az EU Ügyekért Felelős Államtitkárság Győri Enikő államtitkár vezetésével működik. Az EU-ügyekért felelős államtitkár felel az Európai Unió politikáiból eredő és az európai uniós tagsághoz kapcsolódó kormányzati feladatok tárcaközi összehangolásáért. A koordinációs rendszer központi eleme az Európai Koordinációs Tárcaközi Bizottság (EKTB).